Входит ли межвахтовый отдых в испытательный срок?

Однозначно ответить нельзя, потому что зависит от конкретных формулировок в трудовом договоре и от того, как именно оформлен межвахтовый отдых в компании. По общему смыслу трудового законодательства испытательный срок продлевается только на периоды фактического отсутствия работника, например на время болезни, а не на любые предусмотренные графиком паузы в работе. Межвахтовый отдых - это не отсутствие по уважительной причине, а часть самого вахтового режима труда, предусмотренная графиком заранее, поэтому формально приравнивать его к прогулу или отпуску без содержания некорректно.

На практике многое зависит от того, как компания оформила это в локальных актах: если в положении о вахтовом методе прямо написано, что межвахтовый отдых не засчитывается в испытательный срок, работодатель будет ссылаться именно на этот документ, и оспорить это будет сложнее. Пример: если испытательный срок три месяца, а между двумя вахтами человек отдыхал 15 дней, работодатель может утверждать, что фактически отработанного времени меньше трех месяцев, и продлевать срок на это количество дней.

Важно: устное заявление руководителя ничего не значит без письменного приказа о продлении испытательного срока с указанием оснований и точных дат. Попросите показать такой документ и сверьте его с трудовым договором и положением о вахтовом методе именно вашей организации. Если приказа нет, а срок продлевают на словах - это уже повод для письменного обращения к работодателю с просьбой разъяснить основания, а при отказе - в трудовую инспекцию за консультацией по конкретной ситуации, потому что мелкие детали формулировок в каждой компании отличаются и общий совет тут может не сработать без изучения ваших документов.